🌞 Résultat Compatible Avec Une Excrétion Virale Significative Je pense que vous admettez l'erreur.

Question posée le 08/10/2020Bonjour,L’analyse des résultats des tests par RT-PCR qui permettent de mesurer la charge virale de Sars-CoV-2 chez un patient fait l’objet de nombreux débats depuis quelques mois. Ces tests permettent de détecter l’ARN molécule proche de l’ADN du virus dans l’échantillon nasopharyngé du patient, grâce à un processus d’amplification du génome par cycles. Les techniques disponibles permettent de cibler entre 1 et 3 gènes viraux. Plus il faut de cycles pour rendre l’ARN perceptible cette valeur est généralement comprise entre 10 et 45 moins il y a de virus dans l’échantillon prélevé. Ce cycle-seuil CT à partir duquel un résultat est positif est au cœur des débats depuis quelques Etats-Unis, un article du New York Times publié fin août a jeté le doute sur l'utilité de ces tests pratiqués dans le monde entier dans le cadre de la lutte contre l'épidémie de Covid-19, comme nous l'avions expliqué dans une réponse précédente. Avec une valeur du CT très élevée, les tests par RT-PCR peuvent en effet détecter du virus chez des personnes très peu atteintes et peu contagieuses. On trouvera ainsi des personnes positives aux profils très différents.Problématique de quantité virale»Dans le quotidien américain, le professeur d'épidémiologie Michael Mina Harvard a dénoncé une lecture binaire des tests qui sont donc soit positifs, soit négatifs, sans aucune considération, parmi les résultats positifs, du niveau de charge virale du patient dépisté. Ce qui pose, selon lui, un problème dans la prise en charge des patients. Nous utilisons [la binarité du test PCR] pour tout. Pour le diagnostic clinique, pour la santé publique, pour la prise de décisions politiques. C'est vraiment irresponsable, je pense, de ne pas reconnaître qu'il s'agit d'une problématique de quantité [virale]», expose-t-il. Ainsi, tous les résultats positifs ne justifieraient pas une mise en débat agite désormais aussi les spécialistes français. Un résultat positif proche du seuil de détection, donc avec très peu de virus, est rendu avec le même poids qu'un autre avec un CT à 12 ou 15, synonyme d'une positivité certaine et d'une contagiosité potentiellement très forte», déplorait ainsi Sylvie Van der Werf, responsable du Centre national de référence des virus respiratoires de l'Institut Pasteur, dans un article d'Industrie et Technologie, le 11 septembre sur le sujet par le directeur général de la santé, Jérôme Salomon, la Société française de microbiologie SFM a rendu un avis le 25 septembre. A ce jour, aucune recommandation n'a été émise quant à l'interprétation des valeurs de CT et des résultats faiblement positifs. Cependant, la distinction entre les situations à fort ou faible risque infectieux est importante pour prioriser les efforts et les précautions à mettre en place», observe le collège d'experts réuni sous l'égide de la SFM et dont Sylvie Van der Werf est membre.Affiner la lecture des résultats positifsEn se fondant sur les connaissances scientifiques actuelles, les spécialistes proposent ainsi d’affiner la lecture des résultats positifs. Si du virus est détecté, la SFM conseille au biologiste de qualifier le résultat en fonction de la valeur du CT et du nombre de gènes ciblés et identifiés. Au-dessus d’une valeur de CT à 33, le résultat passe de positif» à positif faible».Le collège d'experts estime donc que cette distinction peut être utilisée pour évaluer si le patient risque d'être encore contagieux. Au-delà de 33, on peut ainsi considérer que le patient est modérément voire très faiblement contagieux. Cette interprétation n'a toutefois rien d'automatique, et doit aussi prendre en compte le tableau clinique de la personne, rappelle la SFM. Un point sur lequel Lionel Barrand, président du Président du Syndicat national des jeunes biologistes médicaux SNJBM, insiste également L'interprétation est clinico-biologique. Le résultat biologique n'est pas un juge de paix. Pour le même CT positif faible, on va interpréter là où il y a un risque. Un patient peut avoir un positif faible au tout début de la maladie et donc ne pas encore être contagieux, NDLR ou à la fin et donc ne plus être contagieux.» Ce qui ne signifiera pas la même chose en terme de gestion» du patient, lire aussiL'OMS a-t-elle reconnu que le Covid tue moins que la grippe ?A noter également que les seuils de cycles proposés par la SFM sont aussi à adapter en fonction de la sensibilité variable des différents tests disponibles sur le marché. Une table des concordances avec les valeurs de référence indiquées par la SFM est publiée en annexe de l’ mise en pratique va venir très vite»En quoi ce distinguo entre les cas positifs et positifs faibles va-t-il modifier la prise en charge des patients ? Dans l'avis, la SFM ne semble pas tirer de conclusions sur l'impact de cette nouvelle catégorisation pour les positifs faibles». Elle rappelle que dans toutes les situations, les mesures et les gestes barrières doivent être respectés». En médecine de ville, les nouvelles recommandations ne semblent pas encore vraiment avoir infusé. Ce n'est pas encore mis en pratique, mais ça va venir très vite. L'avis est encore récent», estime Jean-Paul Ortiz, président de la Confédération des syndicats médicaux français CSMF. La note de la SFM est consultative et ne comporte d'ailleurs aucune obligation de cette démarche, d'après Bruno Lina, virologue et membre du collège d'experts, est de simplifier la gestion des patients, sans faire prendre de risque à qui que ce soit». Certains résultats donnés tardivement dans la maladie restaient positifs. Initialement, on a mis en place des tests PCR extrêmement sensibles. Très rapidement, on s'est rendu compte qu'ils étaient capables de détecter de l'ARN viral chez des patients asymptomatiques et non contagieux. Désormais, on est sur une logique de rendu, non pas sur du descriptif de présence ou non d'agent infectieux, mais plutôt sur le risque de contagion», développe le spécialiste. Le problème actuellement, c'est si on fait un test à J+7, et que le patient est positif. Dans le doute, on dit "attendez un peu"», abonde Jean-Paul les nouvelles recommandations de la SFM, la lecture des résultats sera donc simplifiée». Pour les patients en fin de maladie avec une PCR faiblement positive, le médecin pourra recommander de reprendre la vie courante, le travail au contact des fragiles, le retour à l'école, etc.» Pour les patients asymptomatiques au moment du test et des résultats, l'interprétation reste moins simple. Ils sont peut-être au début des signes cliniques. On va replacer le test dans son contexte», explique Bruno valeur du CT fixée par les laboratoiresA l'hôpital, Alexandre Bleibtreu, infectiologue à la Pitié-Salpêtrière, explique déjà se référer à l'avis de la SFM pour la prise en charge des patients positifs au Covid. Si un patient arrive pour un autre problème et que le CT est supérieur à 33, on considère qu'il n'est pas contaminant. Il n'est donc pas forcément hospitalisé dans les unités dédiées», illustre-t-il. Autre cas Quand après quinze jours d'hospitalisation, vous voulez renvoyer un patient en Ehpad, et qu'il avait une PCR positive extrêmement faible, la structure disait "Non, vous ne nous le ramenez pas"», ajoute de son côté Bruno Lina. Désormais, avec les nouvelles recommandations, le patient pourra retourner dans l' lire aussiCovid-19 La vision d'un vaccin efficace dans quelques mois est illusoire»A noter que si l’avis de la SFM crée donc deux catégories de positifs, il ne recommande aucun seuil au-delà duquel le test positif devrait être considéré comme négatif. Seule exception, un résultat positif» peut aussi être interprété comme négatif» si un seul gène sur deux ou trois ciblés est repéré et que le CT est supérieur à 37, conseille la SFM. La valeur du CT – donc le nombre de cycles à partir duquel un résultat est positif – demeure fixée par les laboratoires, en fonction des recommandations des fournisseurs.

Une nouvelle hausse des malades en réanimation et plus de 20 000 nouveaux cas positifs. Les indicateurs de l’épidémie de Covid-19 se sont encore détériorés ces dernières 24 heures avec un nouveau record, selon les chiffres publiés par Santé Publique France vendredi 9 nombre de malades du Covid-19 hospitalisés en réanimation a légèrement grimpé vendredi, selon l’agence sanitaire. Au total, 1 439 personnes sont en réanimation, soit 21 de plus que la veille, soit encore un nouveau record depuis suite après la publicitéLes nouvelles admissions en réanimation, l’un des autres indicateurs importants pour suivre l’évolution de l’épidémie, puisque le principal enjeu est d’éviter que les hôpitaux ne soient débordés par un afflux massif de patients, sont en hausse également avec 150 patients, soit 36 de plus que la pic de l’épidémie, début avril, plus de 7 000 malades étaient hospitalisés dans ces services, essentiellement ceux qui avaient besoin d’être placés sous respiration artificielle. Ce nombre a ensuite fortement chuté jusqu’à fin juillet, puis a évolué dans une fourchette comprise entre 350 et 400 patients jusqu’à fin août, avant de reprendre en augmentation constante. La capacité nationale actuelle est d’environ 5 000 lits de réanimation. Il faut faire le deuil d’un monde sans coronavirus »De nouvelles villes en alerte maximale Les séjours à l’hôpital, qui englobent également des formes un peu moins graves de la maladie, poursuivent leur augmentation continue 7 843, +240 par rapport à la veille, dont 848 nouveaux 339 nouveaux cas de contamination par le coronavirus ont été détectés au cours des dernières 24 heures, un record depuis l’utilisation des tests à grande suite après la publicitéLe taux de positivité des tests proportion des personnes positives sur l’ensemble des personnes testées continue sa progression et dépasse pour la première les 10 %, à 10,4 %.Les conseils d’un épidémiologiste si vous comptez faire la fête malgré les recommandationsDans les dernières 24 heures, 62 personnes sont mortes du Covid, portant le total de décès à l’hôpital ou en Ehpad depuis le début de l’épidémie à au moins 32 à la détérioration de la situation, le gouvernement a annoncé jeudi le passage au cours du week-end de Grenoble, Saint-Etienne, Lyon et Lille en zone d’alerte maximale. Ces villes rejoignent ainsi Aix-Marseille et Paris à ce niveau d’alerte synonyme de bars fermés et restaurants qui doivent limiter leur accueil, de salles de sport fermées etc..

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